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子虚乌有的女巫“作案”
受害者300年后才恢复名誉
面对越演越烈的审判案，也有人保持了清醒的头脑并开始质疑。波士顿著名的牧师、哈佛大学校长英克里斯·马瑟发表了《良心案》一文，他指出“错放过十个女巫也比错杀一个无辜的人好”——这一著名的言论成为了后世美国司法界的一个重要原则。
女巫小镇
到了10月初，连总督自己都不相信小小的塞勒姆竟然会有如此之多的女巫。从这时起，塞勒姆人突然恢复了理智，指控女巫的风潮突然消退了，人们好像不约而同地从梦魇中醒来。随即，总督下令停止审判，释放所有囚徒，审判案终于结束了。但直到1992年，审判案300周年时，马萨诸塞州议会才通过决议，宣布为所有“塞勒姆女巫审判案”的受害者恢复名誉，克林顿政府也再一次向受害者的后人进行道歉。
然而令人不解的是，塞勒姆的审判法庭一解散，当人们不再相信有女巫作祟的时候，那些身患怪病的少女竟然突然痊愈了，她们身上的所有症状也都消失得无影无踪。后来，她们都正常地长大、出嫁，度过了一生。
关于塞勒姆少女的奇怪症状，长期以来比较一致的观点认为：这是一种“集体歇斯底里”，多发病于比较孤僻的少女群体，和环境的压抑也有一定的关系。而症状暴发后，通常会在一段时间后自然消失。
此外，目前还有科学家声称：少女们所患的是一种名为“昏睡性脑炎”的传染病，它的主要症状是高烧、神智不清、产生幻觉，可能引起长时间昏迷，有时还伴有肢体痉挛、抽搐等。而且脑炎最主要的传染媒介是蚊子——1692年春天，塞勒姆遭遇了洪水，温暖湿润的天气导致蚊子大量繁殖，脑炎患者也随之增加。进入秋天后，由于蚊子减少，传播逐渐减弱，“塞勒姆女巫审判案”也宣告结束。
