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《美新周刊》的大学排名是以百分制来评定学校的先后排位，评分的项目共有7项：同行评议25分，新生留校率20分（文理学院、地区性硕士学位大学和综合性学士学位学院这一项25分），毕业率5分，教师资源20分，学生选拔性15分，校友捐赠率5分，财政资源10分。
以下是影响排名的因素和我的分析。我的分析是基于肯定排行榜有重要参考价值的基础上的质疑，目的是引起读者深层理性的思考，提醒读者，影响大学排名的某些因素对未必影响学生的学习和前途。
(1)同行评议（25分）
《美新周刊》的同行评议意见是排行榜各项指标里权重最大的一个指标，这个指标评议学校的学术水平，调查对象是大学的校长、教务长和大学招生院长。每个评议人对各学校可以打1～5分。哈佛大学、普林斯顿大学、麻省理工学院和斯坦福大学在这一项都获得了最高分，为4.9分。
大学校长要关注大学在全美的竞争地位，教务长是学校的教育掌舵人，招生院长也要了解各个大学。所以，他们都是有资格的评议人。不过，他们也不可能对美国千所大学都有很深入的了解。所以，同行评议其实主要是来自于一般的印象，大学的名气可能扮演了重要的角色。
(2)新生留校率（20分/25分）
新生留校率的比重在全国性大学和文理学院里占20%（20分），在地区性硕士学位大学和综合性学士学位学院这两大类学校里占25%（25分）。新生留校率是一个表明新生入学一年后，第二年开学是否还留在本校，并且直到毕业的总指标。新生留校的比例越高，得分越高。新生留校率又细分为两项指标：大学毕业率和新生留校率，分别占这一项的80%和20%。
新生留校率最高的依次为哈佛、普林斯顿、耶鲁，均为98％。进了名校就不肯走了，这是可以理解的。那么，还有2%新生去了哪里？实际上，在哈佛、耶鲁也有人呆不下去退学的。新生留校率是一个比较复杂的指标，第二年开学没有留下来有各种各样的原因：可能是成绩不良退学，有的是“蓄谋”已久，入学前就准备“跳槽”到其他学校。
一般来说，私立学校的新生留校率比较高，公立学校的留校率比较低，原因之一是私立大学师生比较高，教学质量较好，公立大学的师生较低，大班上课可能影响教学，学生喜欢小班教学。
(3)毕业率（5分）
大学毕业率指的是学生在6年之内完成大学本科学习并且毕业的学生比例。2006年普林斯顿，耶鲁大学的毕业率并列第1名，哈佛排第3名。
只有全国性大学和文理学院才计算毕业率，这是因为不少在地区性的硕士学位大学和综合性学士学位学院里的学生，本来就没有准备在那里学完大学阶段的课程。这些学校受到学生转学的影响，所以毕业率都不高，把这个指标拿来评议学校的质量是太不公平的。
哈佛大学的6年毕业率最高，达98%；其次为普林斯顿和耶鲁大学，达96%。全美排名前10名的名校中，加州理工学院的毕业率最低，只有89%。加州理工学院有11%的学生不能毕业，并不是说学校的教学质量差，而是说明学校的要求太过严格了。这一点与中国的大学很不同，中国的大学是“进门难，出门容易”；美国大学是“进门容易，出门难”。美国排名前50名的全国性大学中有11所大学毕业率在80%以下。也就是说，这些学校每年都有数千人没能读到毕业。
不论是什么原因影响了学生的“不留校”和“不毕业”，毕业率都难以成为判定一个学校好坏的根据。毕业率较低的大学如约翰斯·霍普金斯大学为89%，伯克利大学的为83%。它们都因为治学严谨而被扣了分。
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